分布式部署方式，主要是针对较为简单的应用系统而使用的部署方式。一般采用两到三台密码机为一个应用系统提供密码服务。正常的交易使用单台密码机即可完成处理任务，但为了保证系统的可用性，一般多配备一到两台密码机进行热备，当一台密码机出现故障，立即切换到处于备份状态的密码机进行处理，保证业务系统的正常运行。 此种分布式部署方式每种应用都配置一台或多台密码机，简单、快捷，能够快速地构建保证金融交易系统安全的防护体系。
集中式部署方式，主要是针对复杂的银行交易系统而采用的部署方式，即多台密码机共同为多个应用系统提供密码服务。一方面，目前银行的业务种类繁多，如网上银行、移动支付、银行卡业务、理财业务等等。另一方面，此款密码机性能高、功能强，完全可以同时为多个应用系统提供密码服务。因此可以采用多机-多应用方式进行部署，以达到资源共享，降低成本，同时提高密码机利用效率和提高系统可用性的目的。 为了简化密码机的调用和管理，可以增加密码服务平台来进行密码机的调用和管理，实现多机热备、负载均衡、密钥同步、设备状态查询等功能，同时实现密码设备、密钥、涉密数据的集中管理。